MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015851	AACC	2	8	51206	51213	50 %	0 %	0 %	50 %	340783679
1002	NC_015851	TCAGCC	2	12	51243	51254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783679
1003	NC_015851	AAT	2	6	51267	51272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783679
1004	NC_015851	GCA	2	6	51307	51312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783679
1005	NC_015851	GC	3	6	51351	51356	0 %	0 %	50 %	50 %	340783679
1006	NC_015851	GAT	2	6	51523	51528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783679
1007	NC_015851	ATAA	2	8	51627	51634	75 %	25 %	0 %	0 %	340783679
1008	NC_015851	TTTCC	2	10	51778	51787	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_015851	GCC	2	6	51880	51885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783680
1010	NC_015851	CCA	2	6	51895	51900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783680
1011	NC_015851	ACTG	2	8	51957	51964	25 %	25 %	25 %	25 %	340783680
1012	NC_015851	ATA	2	6	51973	51978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783680
1013	NC_015851	T	6	6	52077	52082	0 %	100 %	0 %	0 %	340783680
1014	NC_015851	GAT	2	6	52083	52088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783680
1015	NC_015851	TGC	2	6	52149	52154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015851	TGA	2	6	52179	52184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015851	TCT	2	6	52203	52208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015851	CAG	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015851	GTTCTT	2	12	52249	52260	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1020	NC_015851	GTG	2	6	52268	52273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015851	GTC	2	6	52278	52283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015851	CGA	2	6	52337	52342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783681
1023	NC_015851	CAC	2	6	52367	52372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783681
1024	NC_015851	CA	3	6	52394	52399	50 %	0 %	0 %	50 %	340783681
1025	NC_015851	TATC	2	8	52446	52453	25 %	50 %	0 %	25 %	340783681
1026	NC_015851	GCG	2	6	52577	52582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783682
1027	NC_015851	CTG	2	6	52614	52619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783682
1028	NC_015851	CGG	2	6	52621	52626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783682
1029	NC_015851	GGA	2	6	52676	52681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783682
1030	NC_015851	AGAGGG	2	12	52721	52732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783682
1031	NC_015851	CAT	2	6	52816	52821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783682
1032	NC_015851	AGA	2	6	52891	52896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
1033	NC_015851	CA	3	6	52902	52907	50 %	0 %	0 %	50 %	340783682
1034	NC_015851	CTG	2	6	52908	52913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783682
1035	NC_015851	GCC	2	6	52968	52973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783682
1036	NC_015851	GAG	2	6	52976	52981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783682
1037	NC_015851	TCA	2	6	53028	53033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783682
1038	NC_015851	AGA	2	6	53059	53064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
1039	NC_015851	GCA	2	6	53129	53134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783682
1040	NC_015851	TGA	2	6	53236	53241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783682
1041	NC_015851	CGC	3	9	53276	53284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783682
1042	NC_015851	AGA	2	6	53288	53293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
1043	NC_015851	ATA	2	6	53376	53381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783683
1044	NC_015851	ATC	2	6	53421	53426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783683
1045	NC_015851	CG	3	6	53484	53489	0 %	0 %	50 %	50 %	340783683
1046	NC_015851	TTC	2	6	53493	53498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783683
1047	NC_015851	GAT	2	6	53547	53552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783683
1048	NC_015851	ATAC	2	8	53632	53639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_015851	C	7	7	53639	53645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_015851	GCT	2	6	53690	53695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015851	TGAG	2	8	53821	53828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015851	CAT	2	6	53863	53868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015851	CGA	2	6	53915	53920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015851	CGGGC	2	10	53966	53975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_015851	GCC	2	6	54005	54010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015851	GCC	2	6	54046	54051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_015851	TCA	2	6	54131	54136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015851	GCG	2	6	54137	54142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015851	TCG	2	6	54182	54187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015851	AGA	2	6	54190	54195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015851	CTC	2	6	54215	54220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_015851	TTGG	2	8	54245	54252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015851	CAG	2	6	54309	54314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015851	CAA	2	6	54335	54340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015851	T	6	6	54345	54350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015851	AGTC	2	8	54372	54379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_015851	A	7	7	54392	54398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015851	CAAA	2	8	54414	54421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_015851	A	6	6	54419	54424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015851	ACT	2	6	54493	54498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015851	GAT	2	6	54547	54552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015851	GGA	2	6	54570	54575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015851	CAGT	2	8	54743	54750	25 %	25 %	25 %	25 %	340783684
1074	NC_015851	GCT	2	6	54797	54802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1075	NC_015851	GC	3	6	54848	54853	0 %	0 %	50 %	50 %	340783684
1076	NC_015851	CAT	2	6	54864	54869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
1077	NC_015851	CCGCG	2	10	54870	54879	0 %	0 %	40 %	60 %	340783684
1078	NC_015851	TCA	2	6	54937	54942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
1079	NC_015851	CGG	2	6	54979	54984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
1080	NC_015851	ACC	2	6	55069	55074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783684
1081	NC_015851	TGG	2	6	55090	55095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
1082	NC_015851	CGG	2	6	55138	55143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
1083	NC_015851	TGG	2	6	55159	55164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
1084	NC_015851	CGC	2	6	55168	55173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783684
1085	NC_015851	CTT	2	6	55196	55201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783684
1086	NC_015851	TC	3	6	55292	55297	0 %	50 %	0 %	50 %	340783684
1087	NC_015851	TACC	2	8	55403	55410	25 %	25 %	0 %	50 %	340783684
1088	NC_015851	TGGC	2	8	55479	55486	0 %	25 %	50 %	25 %	340783684
1089	NC_015851	TGG	2	6	55491	55496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
1090	NC_015851	CGA	2	6	55497	55502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1091	NC_015851	TCA	2	6	55531	55536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
1092	NC_015851	CCAC	2	8	55636	55643	25 %	0 %	0 %	75 %	340783684
1093	NC_015851	CTT	2	6	55742	55747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783684
1094	NC_015851	GAC	2	6	55800	55805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1095	NC_015851	CTG	2	6	55806	55811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1096	NC_015851	CGC	2	6	55824	55829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783684
1097	NC_015851	GCG	2	6	55844	55849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
1098	NC_015851	GC	3	6	55863	55868	0 %	0 %	50 %	50 %	340783684
1099	NC_015851	G	6	6	55871	55876	0 %	0 %	100 %	0 %	340783684
1100	NC_015851	TGA	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783684
1101	NC_015851	GCG	2	6	55950	55955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
1102	NC_015851	GACT	2	8	56011	56018	25 %	25 %	25 %	25 %	340783684
1103	NC_015851	CGA	2	6	56030	56035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1104	NC_015851	CGC	2	6	56081	56086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783684
1105	NC_015851	GCGA	2	8	56106	56113	25 %	0 %	50 %	25 %	340783684
1106	NC_015851	CACCAT	2	12	56147	56158	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340783684
1107	NC_015851	GGTGA	2	10	56205	56214	20 %	20 %	60 %	0 %	340783684
1108	NC_015851	TGG	2	6	56233	56238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
1109	NC_015851	TCC	2	6	56323	56328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783684
1110	NC_015851	TGC	2	6	56371	56376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1111	NC_015851	GCA	2	6	56387	56392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1112	NC_015851	C	6	6	56516	56521	0 %	0 %	0 %	100 %	340783684
1113	NC_015851	AGG	2	6	56569	56574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783684
1114	NC_015851	GCGGG	2	10	56602	56611	0 %	0 %	80 %	20 %	340783684
1115	NC_015851	CCTC	2	8	56650	56657	0 %	25 %	0 %	75 %	340783684
1116	NC_015851	TCG	2	6	56746	56751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1117	NC_015851	TCA	2	6	56788	56793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
1118	NC_015851	CCT	2	6	56828	56833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783684
1119	NC_015851	GTGC	2	8	56982	56989	0 %	25 %	50 %	25 %	340783684
1120	NC_015851	AGA	2	6	56993	56998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783684
1121	NC_015851	GCC	2	6	57039	57044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783684
1122	NC_015851	GCA	2	6	57075	57080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
1123	NC_015851	GAG	2	6	57174	57179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783684
1124	NC_015851	CAC	2	6	57280	57285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783684
1125	NC_015851	GGT	2	6	57312	57317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015851	AACG	2	8	57352	57359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_015851	AGTT	2	8	57370	57377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015851	TCG	2	6	57424	57429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015851	TGC	2	6	57540	57545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_015851	G	6	6	57594	57599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_015851	GTG	2	6	71074	71079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783695
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